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核酸檢測數(shù)據(jù)都去哪兒了?

2021-06-23 13:44:18   作者:   來源:CTI論壇   評論:0  點(diǎn)擊:


  各街道社區(qū)核酸采樣點(diǎn)排長龍,忙碌但有條不紊。
  照嗓子眼那么一捅,24小時后看手機(jī)就行了,核酸檢測竟如此簡單?
  今天我們就講講核酸檢測如何做到如此快速且準(zhǔn)確的。
  從喉嚨到手機(jī),
  你的核酸檢測數(shù)據(jù)都經(jīng)歷了什么?
  被“捅”了那一下之后,你便完成了核酸檢測的任務(wù),而對于檢測整體流程來說,一切才剛剛開始……
  
  攜帶著細(xì)菌、病毒、上皮細(xì)胞的棉簽樣本被封存在試管中,并在第一時間送往檢測中心,核酸提取工作便迅速展開!
 
  檢測中心的工作人員通過引物與核酸之間的反應(yīng)獲取檢測結(jié)果,生成的檢測結(jié)果會與你在排隊(duì)時被掃碼收集的個人信息通過人工搬運(yùn)或拷貝等方式共同通過存儲采集至醫(yī)檢機(jī)構(gòu)總部數(shù)據(jù)中臺。
  如果把視角放得更寬,目前個別地區(qū)依然存在疫情復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn),各街道、社區(qū)設(shè)立的醫(yī)檢分支的核酸數(shù)據(jù)采集就已經(jīng)是極為龐大的工作量!
  當(dāng)核酸檢測數(shù)據(jù)采集完畢至數(shù)據(jù)中臺存儲后,工作人員需要通過存儲對新增的入庫數(shù)據(jù)進(jìn)行監(jiān)控,并向數(shù)據(jù)中心推送數(shù)據(jù)新增清單,為下一步核酸檢測數(shù)據(jù)分析做準(zhǔn)備。
  
  數(shù)據(jù)入庫以后,工作人員會對不同區(qū)域的核酸檢測數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。這個過程涉及對存儲頻繁的數(shù)據(jù)檢索與調(diào)用,對檢索效率有著極高的要求,檢索要敏捷,分析要迅速。醫(yī)檢機(jī)構(gòu)會將個人核酸檢測報(bào)告發(fā)送給每個人,同時根據(jù)數(shù)據(jù)分析結(jié)果上報(bào)不同區(qū)域的疫情狀態(tài),對于疫情威脅采取相應(yīng)措施。
  
  
  注意到了嗎?數(shù)據(jù)存儲貫穿了核酸數(shù)據(jù)的采集、入庫、分析的每一步,甚至可以說存儲對數(shù)據(jù)的收集能力、快速推送能力、檢索能力時刻影響著核酸檢測流程的整體效率!
  深信服助力核酸醫(yī)檢“新速度”
  新冠疫情讓更多人知道了新冠核酸檢測,但對于承擔(dān)檢測工作的機(jī)構(gòu)卻了解甚少,事實(shí)上,除了各地疾控中心和醫(yī)院檢驗(yàn)科,第三方醫(yī)學(xué)檢測機(jī)構(gòu)也是提供新冠檢測服務(wù)的重要組成部分。
  從2020年初疫情爆發(fā),到如今的抗疫常態(tài)化,各大醫(yī)檢機(jī)構(gòu)一直扮演著“逆行者”的角色,從各街道、社區(qū)的海量的核酸采樣、到快速檢測、數(shù)據(jù)入庫發(fā)布結(jié)果,醫(yī)檢工作人員通過無數(shù)個日夜的堅(jiān)守,為人們提供快速便捷的服務(wù),用一份又一份的核酸檢測報(bào)告給市民送去安心。
  在核酸快速檢測、強(qiáng)大的數(shù)據(jù)駕馭能力的背后,是深信服分布式存儲EDS的支撐。深信服EDS通過構(gòu)建生物信息數(shù)據(jù)管理系統(tǒng),覆蓋海量醫(yī)檢數(shù)據(jù)采集、治理、檢索全流程,為某第三方醫(yī)檢機(jī)構(gòu)的大數(shù)據(jù)平臺提供底層存儲能力支持。
  1.醫(yī)檢數(shù)據(jù)的自動化采集
  各醫(yī)檢分支機(jī)構(gòu)數(shù)據(jù)采集流程安全可靠全自動化,從每日百GB的人工數(shù)據(jù)采集量提升到了“無窮大”,實(shí)現(xiàn)了RPA全自動化生物數(shù)據(jù)采集業(yè)務(wù)流程。
  某第三方醫(yī)檢分支機(jī)構(gòu)通過使用EDS aDMT數(shù)據(jù)采集工具,將采集工具安裝在醫(yī)檢設(shè)備服務(wù)器上,完成采集策略配置后,當(dāng)醫(yī)檢數(shù)據(jù)在本地服務(wù)器生成,采集工具的探針會感知數(shù)據(jù)的生成,數(shù)據(jù)生成結(jié)束會自動通過https加密協(xié)議將醫(yī)檢數(shù)據(jù)自動采集到總部實(shí)驗(yàn)室的大數(shù)據(jù)對象存儲資源池。
  深信服研發(fā)團(tuán)隊(duì)為了幫助分析師更好地完成數(shù)據(jù)采集,對aDMT在下載安裝、策略配置、一鍵采集等環(huán)節(jié)都做好了防護(hù)策略,并通過斷點(diǎn)續(xù)傳、服務(wù)器重啟aDMT自啟動等手段來滿足數(shù)據(jù)采集服務(wù)的長期穩(wěn)定運(yùn)行,而不會影響醫(yī)學(xué)分析師的日常工作效率。
  2.提升醫(yī)檢數(shù)據(jù)入庫效率
  深信服EDS是一款遵循Low-code原則的智能化存儲平臺,可以根據(jù)用戶約定的數(shù)據(jù)格式和API規(guī)范,完成數(shù)字化訂閱。傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)入庫是將非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)通過采集、轉(zhuǎn)換、裝載,一條一條地插入到用戶的數(shù)據(jù)庫中,在這個過程中,需要監(jiān)控新增的數(shù)據(jù)增量變化情況,通過編寫監(jiān)控腳本完成數(shù)據(jù)變化的監(jiān)控,然后將新增的數(shù)據(jù)再通過編寫腳本完成數(shù)據(jù)、元數(shù)據(jù)信息的數(shù)據(jù)庫錄入。
  采用EDS Low-code的數(shù)字化訂閱服務(wù),幫助醫(yī)檢中心的大數(shù)據(jù)分析師制定好API格式、字段后,EDS數(shù)字化訂閱服務(wù)會根據(jù)用戶的API字段將需要的數(shù)據(jù)信息提取出來,自動推送給大數(shù)據(jù)分析平臺,平臺接收到信號后會自動完成相關(guān)數(shù)據(jù)信息的數(shù)據(jù)庫入庫。
  相比傳統(tǒng)方式,EDS幫助大數(shù)據(jù)分析節(jié)省了無效的編碼工作,并且數(shù)據(jù)采集更加精確,根據(jù)實(shí)際統(tǒng)計(jì)EDS幫助該第三方醫(yī)檢機(jī)構(gòu)提高了數(shù)據(jù)入庫效率,日數(shù)據(jù)治理量從每日1萬條提升到10萬條,開發(fā)部門對數(shù)據(jù)入庫和結(jié)構(gòu)化的效率提高,整體業(yè)務(wù)流程更加順暢高效。
  3.全面提升數(shù)據(jù)檢索效率
  深信服EDS通過對象存儲數(shù)據(jù)管理平臺提供數(shù)據(jù)檢索服務(wù),面對上億規(guī)模的醫(yī)檢非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù),深信服利用自研Phxkv分布式數(shù)據(jù)庫,降低元數(shù)據(jù)在I/O路徑和資源等方面不必要的性能消耗與寫入次數(shù),提升整體性能,輕松承載百億規(guī)模的元數(shù)據(jù)。
  在滿足百億級別元數(shù)據(jù)信息存儲的同時,所消耗的空間僅占常用960GB SSD的50%,精準(zhǔn)合理的元數(shù)據(jù)編排規(guī)劃,能夠幫助管理員日檢索數(shù)據(jù)量從10條提升到“無窮條”,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)檢索0等待。
  后疫情時代,深信服分布式存儲EDS深耕醫(yī)檢大數(shù)據(jù)數(shù)字化場景, 將智能化的統(tǒng)一存儲能力以及便捷的數(shù)據(jù)管理服務(wù)幫助第三方醫(yī)檢機(jī)構(gòu)構(gòu)建醫(yī)檢大數(shù)據(jù)存儲底座,攜手提高醫(yī)檢大數(shù)據(jù)平臺的建設(shè)效率,共同造福于民。
【免責(zé)聲明】本文僅代表作者本人觀點(diǎn),與CTI論壇無關(guān)。CTI論壇對文中陳述、觀點(diǎn)判斷保持中立,不對所包含內(nèi)容的準(zhǔn)確性、可靠性或完整性提供任何明示或暗示的保證。請讀者僅作參考,并請自行承擔(dān)全部責(zé)任。

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